30 июня 2016 года самолёт, который должен был отправиться в московский аэропорт Внуково, не мог вылететь из Белгорода почти шесть часов. Белгородская транспортная прокуратура установила, что причиной задержки рейса стала техническая неисправность автопилота. Но резервный борт авиакомпания не предоставила.
В отношении «ЮТэйра» возбудили дело об административном правонарушении, предусмотренном ч. 3 ст. 14.1.2 КоАП РФ «Осуществление предпринимательской деятельности в области транспорта с нарушением условий, предусмотренных лицензией».
Суд оштрафовал авиакомпанию на 100 тыс. рублей.