Правительственная гарантия выдаётся фонду по кредитной линии на 150 млн рублей под 9,5 % годовых, которую организация получила в Альфа-банке. Сам фонд является микрофинансовой организацией, подконтрольной правительству.
Сейчас организация выдаёт кредиты под инвестпроекты до 3 млн рублей на три года по ставке от 5,25 до 8,25 %. При этом самую низкую ставку получают проекты в области сельского хозяйства. Помимо этого фонд финансирует бизнесменов на срок до пяти лет под 10–13,9 % годовых.
Основным источником финансирования проектов у фонда являются целевые ресурсы Российского банка поддержки малого и среднего предпринимательства (МСП банка).
За деятельностью фонда и эффективностью его инструментов кредитования следит региональный департамент экономразвития.
Правительство Белгородской области в последние несколько лет резко ограничило выдачу госгарантий под различные проекты. Мера связана с желанием властей сократить госдолг региона. Однако выдача гарантий фонду поддержки предпринимательства сохранилась.